时代在发展，科技在进步，海盗的装备不仅变得现代化，而手段也更狡猾，更讲究策略。一些有组织的海盗集团，除了在各地有“线人”通风报信外，还派人到新加坡、泰国、菲律宾、马来西亚、香港等地区，收集猎物航线和所载货物品种信息，谋定而后动，得手后将船只沉没，扬长而去。
有的现代海盗则进行船只“买卖”。他们可以安排“买家”入住港口附近的高级宾馆看“货”。“买家”看中港口的某一艘船后，海盗便设法将船弄到的，改头换面后，以十至三十万美元的价格售给串通的“买家”。
而在南洋联邦情报局和国际海事局的协助下，菲律宾警方在马尼拉湾的宾馆套房内抓获了另一名海盗头子博尼托。这个海盗集团花三十万美元，长期包下这间宾馆的套房，监视海湾内船只动态，并下达抢劫命令。如果下达的是“不留人”的命令，则轮船上的船员不是就地处死，就是被抛入海中。狠毒的盗不仅要钱，要钱，还要人命。
从一九六四年十一月开始的第一次联合扫荡海盗行动一直持续了六个月之久，消灭了最凶名昭著的五个大海盗集团，击毙海盗数百人，捣毁海盗巢穴数十处，并初步建立起一套行之有效的防范机制。
以南洋联邦为首，联合马来西亚、泰国、越南王国、菲律宾四国水警建立起统一的指挥机构，分别在南洋联邦的棉兰、新加坡、班达亚齐、巴眼巴比、塞邦卡岛、劳特岛、米里、山打根，泰国的宋卡、曼谷，马来西亚的吉隆坡、槟城、巴生、哥打巴鲁，菲律宾的三宝颜、马尼拉，越南王国的堤岸、快岛，建立起机动出击基地，不仅配备快艇，还装备了直升机。并在新加坡、吉隆坡、马尼拉建立起接警指挥中心，接到报警即可指挥就近的水警追击海盗。
一个区域性的联合反海盗中心能够比较有效地避免以前各国互相推诿的弊病，而使用相同的通讯频率，加强联系，联手缉盗，被证明是对海盗最有威胁的打击手段。
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