跟任何从战乱废墟中恢复起来的政权一样，此时的长崎小朝廷，也面临着灾难式的财政危机。
绵延一年的内战，不仅彻底打空了国库，还把几座最繁华的主要城市都化作了一片废墟。而将近三分之二人口的消失，更是让国内的商业网络几乎崩溃，原本最丰厚的商税和关税，暂时是没法指望了。
而青壮年劳动力的严重匮乏，以及跌落到1：2以下的男女比例，也让今年的秋收和农税充满了危机。
虽然熊泽天皇陛下的皇位和朝廷，还有原大阪财阀+耐色瑞尔帝国远东驻军的实际统治模式，已经初步得到了全国范围的承认。但这并不意味着整个政权结构就已经建立起来了。尤其是最为关键和重要的税收体系，迄今仍然处于可悲的半瘫痪状态之中。
更可悲的是，九州岛和四国岛的领地虽然已经收归中央，可今年的赋税，却被旧藩主们在转封之前给抓紧时间“预征”了，若是再继续搜刮，很有可能逼迫得贫民没了活路，甚至于跳起来发动暴乱。
至于东北，西国各藩的诸侯，虽然已经臣服，但依然基本保持着自治的局面，除了少量的象征性贡金之外，不会给中央直接上缴任何税款。
但是，在各项收入急剧减少的情况下，政府的基本开支却依然浩大。
最要命的是，除了天文数字一般的重建和迁都费用，以及维持政府运转的基本开销之外，这个实际辖地和人口都很可怜的九州岛小朝廷，眼下还必须供养一支将近三万人左右的庞大军队。
这支军队在战争时期，乃是三井龙姬大小姐得以扫平列岛、慑服群雄，从而跻身为“天下人”的有力依靠。但到了和平年代，却成了一个巨大的财政包袱和隐患。
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