龙汉大劫结束后，洪荒世界不仅没有安静下来，反而变得更加混乱。没有了龙凤麒麟三族的镇压，所有的种族开始疯狂的发展自己的实力，争抢地盘，向外扩张。其中发展最快的势力之一便是由妖帝帝俊，东皇太一统领的妖族。妖帝帝俊和东皇太一本是太上由至阳的炎力孕育而生的两只金乌，龙汉大劫来临之前，这两兄弟一直藏在太阳上潜修，龙凤三族灭亡后，洪荒世界变成了无主之地，两人便知道机会来了，进入洪荒大展拳脚，因为实力强悍和心狠手辣，帝俊和太一用了三十万年的时间将洪荒世界所有妖族全部统一，瞬间成了洪荒第一势力，大有主宰洪荒的趋势。
而妖族蓬勃发展的同时，另一个神秘种族也正在崛起，那就是巫族。巫族诞生于天柱不周山，没有人知道这个种族的来历，但是他们就这样陡然出现在洪荒世界的舞台上，由十二祖巫，无数大巫带领的巫族也在短短三十万年的时间以不周山为据点，扫清了除妖族外洪荒大地上的所有异族，渐渐竟然拥有了足以和妖族抗衡的强大实力。
巫妖两族最初还是和平的相处，因为最早的洪荒资源充足，灵气丰富，足够供给两族享用。除此之外，吸取龙汉大劫教训的巫妖两族还顾忌着其他高手坐收渔翁之利。龙汉大劫过后，被龙凤三族压制的各大高手开始崭露头角，太上三清，红云，镇元子，东王公，燃灯，女娲，伏羲，冥河以及鲲鹏等强者相继成名。这些人虽然没有自己的势力，但个人的实力都强横至极，隐隐威胁着巫妖两族的统治。于是妖族和巫族达成协议，妖族掌管天空，巫族掌管大地，互不侵犯。
两族竟然和平供出了二十多万年，但渐渐的，修行之人越来越多，天地灵气变得稀少，各种资源也渐渐露出了匮乏之态，两族的矛盾终于表露出来，从最初的小摩擦到了大规模的战争。于是一百五十万年前，第一次巫妖大战爆发，当时妖族的实力比巫族还要强上一些，将巫族打败，赶回了不周山中。巫族于是开始卧薪尝胆，养精蓄锐，终于，在一百四十万年前，巫族趁东皇太一去天外天修行时突然发难攻打妖族，十二祖巫联手将妖帝帝俊打成重伤，大巫后羿还射杀了帝俊的九个儿子，妖族惨败，退出了大地，回到了天宫。
此后的二十万年里，巫妖两族都呆在天空和大地上，没有进犯对方，不过谁都知道，这两族都是在韬光养晦，巫妖两族的战争终将会继续打下去，不死不休。
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