钱塘水师成功的突破了兰溪的防线，在由于钱塘水师水左营游击身负重伤垂毙，清军不得以在重新整饬一番后才分出大部转而向西，这些清军的目的便是驱逐明军在衢州的水营，夺取衢江的控制权，以及掩护衢州一线的清军渡江。而另一部分，则继续留在兰溪，以防陈文渡过东阳江回援金华。
衢江西岸的清军在陈文离开后数天才从潜伏在衢州府城的探子那里察觉到了不对劲，可是水营的战舰在侧，却也不敢对强渡衢江有什么太多的想法，只是将骑兵彻底撒了出去，以争夺衢江北岸的控制权。
钱塘水师一路向西，迅速的将龙游县城的那几艘战舰或毁或逐，但是他们的目标不是这里，所以也没有做任何停留便继续前进。只是抵达到衢州后，由于城头的炮火和明军水营的配合下，不得不放弃了聚歼的打算，转而掩护、运送清军越过衢江。
陈文的提前离开时出乎清军众将预料之外的，但是这一举动也使得衢州守军在清军的威胁下放弃了衢州城外的一切，退而固守府城。清军利用严家淤的江心洲在后世衢江大桥以南的一段区域搭建大片的浮桥，并利用城外在明军火炮射程之外的码头来屯集战舰以保护浮桥。
浮桥搭建完毕，三万衢州方向的清军裹挟着略多于此的辅兵大部越过了衢江，将衢州府城团团围住，并开始修建长围和用以防备明军回师的壁垒。
这本就是洪承畴计划中的一部分，只是对于衢州方向的南线清军而言，似乎有点太过容易，也稍微早了一些。
按照洪承畴的计划，清军此番按照地形兵分四路围剿。
起初，北线的浙江提督标营、浙江巡抚标营以及伪装成杭州驻防八旗的定海总兵标营逼近安华镇棱堡，以牵制明军在北线的浦江营；东线的台州绿营和温州绿营则进逼处州府城，牵制那里的守军；而南线来自于江西和福建的两路清军则设法完成合流，与明军主力隔衢江对峙，是为整个计划的第一步。
而到了第二步，僵持的同时，杭州驻防八旗及其援军辅以严州绿营在钱塘水师快速突破明军在兰溪的拦堵后，直取金华府，这是整个计划的关键所在。
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